2002年微免实验室与寄生虫实验室重组成立了病原学与免疫学实验室，2019年由学校规范命名为病原生物学与免疫学实验教学中心。2003年在普通高校基础课教学实验室评估中，被广西教育厅评为条件合格实验室。实验中心面积约530 m²，有4间实验室，实验设备总值约400万，承担医学微生物学、医学免疫学、医学寄生虫学及临床寄生虫及寄生虫检验等课程的实验教学。并开放实验室，在校学生可开展相关微生物学、免疫学的科研实践活动。

目前实验中心专职技术人员4人，高级实验师2人，实验师2人。专职任课教师15人，教授2人，副教授5人，博士3人，在读博士6人。近年来承担国家自然科学基金5项，省级及其他课题30余项。指导大学生创新创业课题立项10余项。教师以第一作者或通讯作者在学术期刊公开发表论文100余篇。主编各类教材5部，参编1部。